Uzumaki Naruto je kluk, sirotek, ze Skryté Listové vesnice, je uřvaný, hyperaktivní a neustále se snaží získat uznání od ostatních. Jeho snem je stát se šéfem vesnice, tak zvaným Hokagem. Příběh začíná tím, že Naruto dokončí zkoušku na ninja akademii a stane se tak ninjou. V týmu s ostatními plní různé více či méně nebezpečné mise (od venčení psů až po zabíjení super nebezpečných zločinců). Naruto je na začátku velmi neoblíbený, protože je do něj zapečetěný démon Kyuubi (liščí démon), který vyvraždil půl Listové vesnice. On sám to až do svých 12 nevěděl. Postupně se ale s ostatními sbližuje a vytváří si přátele. V podstatě celá série je založena na postupném vývoji nejen Naruta, ale i ostatních postav. Dozvíme se hodně o jejich historii, vztazích a dovednostech. Hned na začátku se dozvíme, že Naruto miluje kamarádku z akademie, Haruno Sakuru (Haruno Sakura), která ovšem jeho city neopětuje a snaží se sbalit dalšího z hlavních hrdinů, Uchihu Sasukeho (Uchiha Sasuke). Ten pro změnu zase nechce ji. Jindy se zase dozvíme o drsném mládí Sasukeho, kdy celý jeho klan byl vyvražděn. Velká část příběhu vypráví o Chuuninské (čti čůninské) zkoušce, kdy se rozhoduje o tom, kteří ninjové povýší na další hodnost.Naruto vyrůstá bez rodičů a zdá se mu, že ho všichni nenávidí. Navíc je nejhorší ve třídě, už třikrát propadl a nikdo ho nebere vážně. Naruta na začátku uznávají jenom dvě osoby, a to jeho učitel Iruka a vůdce vesnice 3. Hokage. Hned v prvním dílu se stane to, čeho se Naruto nejvíc obává, a sice proletí jako jediný u zkoušek a musí opakovat ročník a hlavně se zase nestane geninem (nejnižší stupeň ninji).

Za Narutem, který si myslí, že ho Iruka nenávidí a dělá mu naschvály, přijde druhý zkoušející Mizuki. Ten mu řekne, že ho Iruka má rád a že si to nemá tak brát, a poradí mu, že když sebere svitek pečetí (zakázaná nebezpečná věc), nechá ho samotný Hokage povýšit na genina. Naruto, který mu vše věří, svitek ukradne a za chvilku ho honí celá vesnice. Naruto se zatím v klidu učí na místě, které mu Mizuki poradil. Samozřejmě je to všechno jenom Mizukiho past, který pase po svitku a Naruta nenávidí. Naštěstí, ale Iruka dorazí na místo o chvilku dříve než Mizuki, a právě od Mizukiho se Naruto dozvídá strašnou pravdu. Naruto v sobě nosí už takřka od narození devítiocasého liščího démona, který před 12 lety způsobil obrovské škody (hlavně na životech) celé vesnici. Naruto nejdříve chce utéct pryč, když je ale Iruka napaden Mizukim a prohrává, Naruto zakročí a pomocí svitku Mizukiho vyřídí. Mistr Iruka ho nechá jako projev uznání a díků projít zkouškami.Naruto sa dá odfotiť na ninjovský registračný preukaz s pomaľovanou tvárou. Tretí Hokage mu prikáže, aby si tú fotografiu vymenil. Naruto nesúhlasí, použije na neho Sexy jutsu a Hokagemu sa spustí krvácanie z nosa. Do miestnosti sa vrúti malý chlapec menom Konohamaru, vyhlási o sebe, že sa stane Piatym Hokagem a napadne Tretieho shurikenom, no spadne. Chlapec obviní Naruta, že mu nastavil pascu. Medzitým vojde dnu chlapcov učiteľ Ebisu a s nenávisťou pozoruje Naruta, pretože ho považuje za démona. Vysvitne, že Konohamaru je vnuk Tretieho. Provokuje Naruta a ten ho udrie. Ebisu povie Konohamaruovi, aby sa s Narutom nebavil a sľubuje mu, že ho naučí ninjovské techniky, aby sa mohol stať Hokagem, no Konohamaru mu ujde za narutom. Tretí dúfa, že ho nenaučí divné veci. To je samozrejme zbytočná nádej, pretože Konohamaru nazve Naruta svojím šéfom a chce sa od neho naučiť Sexy jutsu. Rozprávajú sa o čakre. Je to energia potrebná k vytvoreniu jutsu. Vzniká kombináciou telesnej a duševnej energie a pri použití ručnej pečate vytvorí jutsu. Naruto mu povie, že ho bude trénovať tvrdo. Prikáže mu, aby sa transformoval do podoby krásnej ženy, stojacej na ulici, no Konohamaru vytvorí jej tučnú a škaredú podobu. Naruto ho vezme do obchodu s erotickými časopismi a neskôr do ženských kúpeľov, no Konohamaruove transformácie sú strašné. Naruto sa ho neskôr opýta, prečo je taký posadnutý svojím starým otcom. Konohamaru mu povie, že práve Tretí mu dal meno Konohamaru po ich dedine (Konoha), no nikto ho tak nevolá. Pre všetkých je len vnukom Tretieho a nikto ho neuznáva ako individualitu. Konohamaru to nenávidí. Naruto mu povie, že aj on sa chce stať jedného dňa Hokagem a že ho bude musieť Konohamaru najskôr poraziť. Medzitým sa Tretí rozpráva s irukom o tom, že jedného dňa budú dedinčania možno naruta uznávať, pretože o tom, že je v ňom démon, vedia len dospelí. Takže Narutovou jedinou nádejou je, že jeho rovesníci to netušia. Tretí tiež povie, že posledným želaním Štvrtého bolo, aby ľudia v Narutovi videli hrdinu. No dospelí to tak nevidia a prenášajú svoje správanie na svoje deti. Keď nejaká osoba nenávidí druhú a neuznáva ju, jej oči sú hrozne chladné, keď na na ňu hľadí. Takto sa díva aj Ebisu na Naruta, keď ho nájde aj s Konohamaruom a Naruto to vycíti. Ebisu chce odviesť Konohamarua, ten vytvorí dokonalé Sexy jutsu, ale na Ebisua neúčinkuje, lebo je vraj slušný človek. Vtedy Naruto vytvorí skombinovaním jutsu viacnásobnej tieňovej replikácie a Sexy jutsu množstvo krásnych nahých blondínok a Ebisu začne krvácať z nosa. Naruto nazve techniku Háremové jutsu. Konohamaru je naštvaný, že neporazil svojho učiteľa a že ho nikto neuznáva. naruto mu povie, že je to ťažké, že aj jeho uznáva len jedna osoba - sensei Iruka a že sa Konohamaru musí pripraviť na to, že niesť titul Hokage je ťažké. Konohamaru mu povie, že od tejto chvíle sú rivalmi. Naruto mu povie, že raz budú spolu bojovať, ale zatiaľ nech sa Konohamaru pozerá vpred. Tretí, ktorý ich pozoroval pomocou sklenenej gule, poznamená, že Naruto práve vykročil na svoju cestu ninju.Příběh začíná Narutem, který právě snídá. Nastává první den Naruta jako ninji. Shikamaru je překvapen, že je Naruto v učebně s ostatními, když proletěl. Naruto mu vysvětlí, že nakonec prolezl. V tu samou chvíli vběhne do třídy Sakura, která soupeří se svou rivalkou Ino, kdo bude ve třídě dřív. Sakura z ničehonic ztuhne a zadívá se zamilovaně Narutovým směrem. Naruto si myslí, že dívka jeho snů se dívá na něj, ale ta se dívá na nejlepšího žáka jejich třídy a potomka legendárního klanu ninjů Sasukeho Uchihu. Hned se kolem něho slétnou všechny studentky a chtějí sedět vedle něho. Naruto se na něj podíva z očí do očí jak 5 cm od něj. Jeden ze studentů do Naruta strčí a ten dá sasukemu pusu. Samozřejmě za to dostane nakládačku od holek.

Nyní nastává výběr skupin, ve kterých budou žáci plnit mise. Naruto samozřejmě skončí se Sakurou, která svůj žal dáva najevo i přes Narutovu oslavu. Vše se obrátí, když jako dalšího z týmu vyberou Sasukeho. Naruto smutní, Sakura oslavuje. Po rozlosování je dán odchod. Naruto po rozchodu zaútočí na Sasukeho. Vypadá to, že Sasuke ho jednoduše přemohl, ale to není tak jisté. Naruto Sasukeho překvapil pomocí stínových klonů a svázal ho. Vzal na sebe Sasukeho podobu a šel za Sakurou zjistit, proč ho nesnáší. Ta mu to vylíčí v jasných barvách. Naruto se v Sasukeho podobě chystá políbit Sakuru, ale zastaví ho křeče v břiše a on utíká na záchod. Sakura si myslí, že je stidlivý.

Příběh začíná týmem 7 čekajícím na svého mistra, který je nechává čekat. Naruto se naštve a na dveře položí houbu na tabuli. Sasuke nevěří, že jonnin na takovou blbost skočí, ale mýlil se. Mistr vystrčil hlavu ze dveří a houba mu spadla na hlavu. Naruto se začal smát a Kakashi řekne první názor na tuhle skupinu - "nesnáším vás".

Kakashi je odvede na střechu akademie, kde se mají představit a říct něco o sobě. Kakashi se představí první a o sobě nechce říct nic. Naruto začne mluvit o ramenu a o tom, že se chce stát Hokage, aby ho všichni respektovali. Sakura o sobě neřekne nic a o svých touhách nepromluví jen se pořád dívá na Sasukeho. Ještě řekne, že nesnáší Naruta. Sasuke o sobě řekne, že chce zabít jistou osobu a obnovit svůj klan. Po téhle krátké zpovědi jim Kakashi oznámí, že 66% studentů se vrátí na akademii, protože neuspějí v testu přežití.

Brzy ráno se sejdou na zkoušku. Protože jim Kakashi řekl, že nemají snídat, tak jsou všichni hladoví. Kakashi přijde pozdě o několik hodin a vytasí na ně blbou výmluvu (nebude poslední). Kakashi jim ukáže dvě rolničky a řekne, že kdo je nedostane bude přivázán ke kůlu a ostatní budou před ním jíst a navíc se vrátí do akademie. Protože jsou zvonečky jenom dva, takže nejmíň jeden vypadne. Navíc jim řekne, že mají bojovat jako by ho chtěli zabít, jinak nemají šanci. Naruto to nevydrží a zaútočí na Kakashiho ještě před započetím a ten ho odzbrojí tak rychle, že ostatní to ani nazareagují. Kakashi řekl, že je moc uspěchaný a pustil ho. Zkouška začala a všichni se schovali, jen Naruto se postavil Kakashimu v tváří tvář. Kakashi řekl, že Naruto je oproti ostatním divný.

Mezitím Iruka navštíví Hokageho, aby se zeptal na pověsti o Kakashim. Hokage mu dá seznam Kakashiho studentů a ten zjistí, že Kakashi ještě žádného studenta nenechal projít. Naruto jde po rolničkách a Kakashi řekne, že ho naučí ninja vlastnost číslo jedna - Taijutsu - a vytáhne z pouzdra knížku. Narutovi řekne, že s jeho mizerným Taijutsu je jedno jestli si čte nebo ne. Kakashi Naruta snadno přemůže a použije na něj Sennen Goroshi, které ho odmrští do vody. Naruto vyleze z vody a zaútočí pomocí stínových klonů. Kakashi však z Naruta udělá blbce, i když ho ze začátku překvapí. Naruto si všimne spadlých rolniček a sáhne po nich, ale tím spadne do jasné pasti. Kakashi Narutovi říká, že nemůže spadnout do tak jasných pastí, když v tom na něj Sasuke hodí šurikeny a zasáhne ho do hlavy. Kakashi v krvi padá na zem.

Příběh opět začíná rekapitulací předchozího dílu, ale my se vrátíme do místa, kdy Narutův kunai míří na Zabuzovu hlavu. Zabuza kunaii uhne, avšak kunai ho řízne pod okem. Uhnutím byl navíc donucen propustit Kakashiho z vodního vězení a jako bonus se rozpadl i vodní klon. Rozčílený Zabuza chtěl hodit shuriken, který stále držel v ruce, na Naruta, ale Kakashi ho zastavil a vyrazil mu shuriken z ruky. Kakashi Naruta poprvé pochválil a Naruto vysvětloval, že jeho cílem nebylo Zabuzu zabít, ale donutit ho k ukončení jutsu. Naruto totiž věděl, že ještě nemá zkušenosti, aby mohl zabít ninju Zabuzovy úrovně. Sakura je navíc podivena, jak Naruto se Sasukem přišli na takovou strategii, a ani si nic neřekli.

Teď nastává souboj Zabuzy a Kakashiho tváří v tvář. Zabuza použije ninjutsu vodního draka, ale Kakashi ho zkopíruje a použije ho taky. Draci se kolem sebe začali proplétat a zničili se navzájem. Tím tohle jutsu skončilo remízou. Zabuza byl velmi zmaten, protože Kakashi ho nejen zkopíroval, ale použil ho ve stejnou dobu. Zabuza začal být nejistý, protože to vypadalo, jako by mu Kakashi sharinganem četl myšlenky. Kakashi navíc použil další techniku dřív než on a pomocí vodního víru s ním mrštil o strom a navíc měl v sobě zaražené kunaie. Zabuza se zeptal Kakashiho, jestli umí číst budoucnost a Kakashi mu řekl, že ano a že teď zemře.

Zrovna když ho chtěl Kakashi dorazit, tak Zabuzovi vletěli jehlice do krku a Zabuza padl mrtvý k zemi. Zabil ho kluk, asi stejně starý jako Naruto s maskou Anbu. Kakashi mu zkontroluje tep a potvrdí jeho smrt. Anbu poděkuje Kakashimu za příležitost Zabuzu zabít. Sakura Narutovi vysvětlí úkol Anbu zabíjet ninji, kteří opustili vesnici a odnesli si její tajemství. Jde převážně o ninji vysoké úrovně, kteří se dostanou k tajným informací a jutsu. Naruto vybuchl, když zjistil, že Zabuzu zabil kluk asi stejně starý jako on. Anbu navíc odnesl Zabuzovo tělo, aby ho mohl zničit, protože jak řekl "tohle tělo má spoustu informací". Naruto po odchodu Anbu úplně vybouchl a začal mlátit pěstmi do země. Kakashi mu řekl, ať si nechá frustraci na později, že mise ještě neskončila. Kakashi udělal krok a z ničeho nic se sklátil v bezvědomí na zem.

Příběh začíná Kakashim ležícím v posteli. Žena, která je tam s ním, se ptá, jestli je v pořádku. Kakashi řekne, že se bude týden sotva hýbat a ona mu odpoví, že by měl ležet. Sakura řekne Kakashimu, že Sharingan je úžasný, ale protože tak moc namáhá tělo, neví, jestli je dobré ho používat. Sakura se zeptá, kdo byl ten kluk s maskou a Kakashi jim znovu vysvětlí úkoly ANBU a to jak se zbavují těl. Při tomto vyprávění je ukázán anbu, jak stojí nad tělem Zabuzi a chystá si nástroje. Ukáže se však, že Zabuza není mrtvý a ANBU mu zastavil na krátko pomocí jehlic tep. Zabuza řekne svému společníkovi, že si mohl vybrat jiné místo než krk, ale on mu na to odpoví, že na krku je nejmíň svalů a je nejjednodušší se tam trefit. ANBU si sundá masku a ukáže se ženský obličej:). Zabuza taky prohlásí, že příště si už se Sharinganem poradí.

Teď už jsme opět u Kakashiho, který přemýšlí, proč ANBU nezlikvidoval Zabuzovo tělo na místě a použil tak málo smrtící zbraně jako jsou jehlice. Kakashi z toho vydedukujel, že je Zabuza stále naživu. Všichni z toho jsou v šoku a Kakashi jim vysvětluje, proč si to myslí. Kakashi jim také vysvětlí, že, i když má ninja jen podezření, musí se připravit dřív, než bude pozdě. Kakashi se zarazí, když si všimne Naruta, který se klepe vzrušením. Na Narutovi je vidět, jak je rád, že je Zabuza naživu. Kakashi jim zadá speciální trénink, aby se pomocí něj na Zabuzu připravili. Sakura, ale začne pochybovat o tom, co trénink zmůže proti ninjovi, jako je Zabuza. Kakashi ale oznámí, že se všichni tři velmi rychle dospívají a Naruto nejvíc. V tom se ve dveřích objeví malý kluk jménem Inari a obejme Tazunu a řekne mu, ,,Vítej zpátky dědo.“ Inari jim všem řekne, že stejně zemřou, jestli půjdou proti Gatouovi. Naruto okamžitě vybouchne a prohlásí, že je hrdina, který se jednou stane Hokagem. Inari mu na to odpoví, že je idiot, protože žádní hrdinové neexistují. Naruto se naštve ještě víc a vrhne se na Inariho, jenže Sakura ho zadrží. Naruto se rozhodne, že dá Inarimu za vyučenou, ale když ho uvidí brečet, tak se na to vykašle.

Trénink začíná. Kakashi nejdřív řekne, ať Sakura vysvětlí, co to chakra je a jak se ovládá. Kakashi jim řekne, že, i když chakru umí používat, neumí ji koncentrovat, a proto jim může rychle dojít nebo jejich jutsu nemají takovou sílu, a proto musí podstoupit tento tvrdý trénink. Trénink obsahuje šplhání po stromě jen za pomoci chodidel, do kterých musí soustředit chakru. Kakashi jim hodí kunaie, aby si značily, jak se zlepšily. Šplh začíná. Naruto nakoncentroval málo chakry, a proto hned sletěl, Sasuke to zase pro změnu přehnal a strom mu pod nohou křupl. Sakura ovšem vyšplhala téměř na vrchol na poprvé, protože, jak se později ukáže, je velký talent v ovládání chakry. Kakashi chce dát Narutovy a Sasukemu motivaci, a proto řekne, že Sakura má větší šanci stát se Hokagem než Naruto. Taky řekne Sasukemu, že Uchiha klan asi až tak skvělý klan není. Naruto i Sasuke už jsou nabuzení, a proto trénink může pokačovat. Kakashi navíc Narutovi a Sasukemu oznámí, že mají neuvěřitelné množství chakry, kterému se Sakura nemůže rovnat, a když se ji naučí ovládat, bude to pro ně jako najít poklad. Mezitím Gatou přijde k raněnému Zabuzovi a posmívá se jeho stavu. Když chtěl na Zabuzu vztáhnout ruku, tak mu ji Zabuzův společník Haku, málem zlomí. Gatouova ochranka chce tasit, ale Haku jim meče vezme tak rychle, že ho při tom není pomalu ani vidět.

Po pár hodinách je už Sakura grogy, ale Naruto a Sasuke dál pokračují v tréninku. Sakura se podívá na Naruta a myslí si, že přesně ví, co se Naruto chystá udělat. Ale ten ji posledním krokem překvapí, protože se jí zeptá na radu. Kakashi, který to sleduje navíc prohlásí, že Narutova zásoba chakry je mnohem větší než Sasukeho a dokonce větší než jeho vlastní, a proto už se nemůže dočkat, co se bude dít, až se ji naučí ovládat.

Příběh začíná pohledem na stavbu mostu a na Sakuru, která má dohled nad Tazunou. Tazuna se ji zeptá, kde jsou ti dva a ona mu odpoví, že Naruto a Sasuke trénují šplhání po stromech. Když se jí Tazuna zeptá, proč netrénuje taky, Sakura s úsměvem odpoví, že je asi výjimečná, a proto ji Kakashi řekl, ať ho hlídá. Za Tazunou přijde jeden z dělníků, který chce přastat pracovat na stavbě mostu ze strachu z Gatoua, a proto ho Tazuna propustí. Nyní jsme u Naruta a Sasukeho, kteří tvrdě trénují. Na stromech je vidět jejich postupné zlepšování. Na jejich obličejích je vidět, že ani jeden z nich nechce prohrát a být horší než ten druhý.

Sakura zatím doprovází Tazunu domů a vidí, jak je město díky Gatouovi chudé a všude jsou hladové děti. Tazuna jí vysvětlí, že most konečně obnoví samostatnost město a to se bude moct zase postavit na nohy. Teď se vracíme opět k tréninku Sasukeho a Naruta, kteří se neustále zlepšují. Sasuke si všiml, že Naruto ho poomalu dohání. Naruto se začne řídit Sakuřinou radou a začne se správně soustředit. Když běží Naruto ke stromu, Sasuke na něho promluví, Naruto zakopne a mrskne sebou o zem. Sasuke se s velmi poníženým výrazem zeptá, co mu Sakura poradila. Naruto se usměje, jak nejvíc může, a pak mu s nekompromisním pohledem odmítne cokoliv říct. Což Sasukeho vytočí a jenom tím prohloubí jejich rivalitu. Rivalita pokračuje i u jídla, když oba jedí tak moc, až se s toho pozvrací.

Po jídle si Sakura všimne fotky na stěně, kde je jedna postava vytrhlá a zeptá se, kdo to je. Tazuna řekne, že je to nevlastní otec Inariho a muž, který byl ve vesnici nazýván hrdinou. Jmenoval se Kaiza a ode dne, kdy se poznali, byli s Inarim jako otec a syn. Kaiza Inariho učil o odvaze a nakonec svoji odvahu dokázal, když zachránil město před potopou tím, že skočil do rozbouřené řeky s lanem a díky němu mohli vesničané lanem přitáhnout zábrany. Kaizu nakonec nechal Gatou zabít před celou vesnicí, protože se mu postavil a kvůli tomu celá vesnice ztratila veškerou odvahu. Kaiza však po celou dobu neztratil odvahu, hrdost a před smrtí, povzbuzoval vesničany, aby se Gatouovi postavili. Když jim to Tazuna dovykládal, Naruto s obtížemi vstal a řekl, ,,Dokážu to, že na tomhle světě ještě hrdinové existují!“. Tímto končí tento díl.